全日制专业学位硕士和学术型硕士是同一层次的不同类型，培养的侧重点不同而已，专业型硕士是为了能更好的适应社会发展的需求，比较注重理论和实践相结合，最终是要发挥实践作用的，而学术型硕士是专门进行理论研究，一般只是作为考博的中间跳板用或者当老师什么的。

全日制专业学位是拿双证的，即研究生学历证书和硕士学位证书。

你两个都可以报考，看你自己考虑了，如果想考完硕士直接找工作的话还是建议你考全日制专业学位硕士比较实用，当然你也可以考学术型硕士，调剂的时候也可以往专业学位硕士调剂的，这两个都是在1月份考试选拔的，学费基本差不多，当然MBA之类的要贵。全日制教育硕士，专业学位（professional degree），其目的是培养具有扎实理论基础，并适应特定行业或职业实际工作需要的应用型高层次专门人才。

全日制硕士研究生和学术型研究生的共同点是都是在每年的一月份参加统一考试，毕业之后都可以获得学历证书和学位证书（双证）；不同点主要是在学制（全日制一般学制在2~3年，学术一般是三年），培养目标，具体说来学术型主要是为了培养高效教师和研究型人才，专业硕士吃从事相关专业和领域的硕士生；全日制和学术型都可以考博，只是全日制不能申请硕博连读。以下是更为详细的比较。

早在20世纪80年代中期，我国的硕士研究生主要是为高校和科研单位培养研究型人才，因此在生源、培养模、毕业生走向等方面比较单一。随着我国改革开放的不断深入，经济不断发展，一些企业等实际部门就提出需要一些高水平的人才，这些人才既需要有一定的工作经验，有具有一定的研究水平。因此，在1984年底国家批准开始招收工程类型工学硕士，之后又有财经、政法加入。准确地说，这些都是应用型硕士，属于过渡学位，还不是正式的专业硕士。1988年根据相关部委的要求，国家学位办到相关部门进行调查论证，作出该学科的设置和招收要求。到了1990年MBA成为第一个招生的专业硕士，之后又制定了专业硕士的暂行办法。到目前为止，专业硕士总共有16种，包括法律硕士（J.M）、教育硕士（Ed.M）、体育硕士、艺术硕士（MFA）、工程硕士、农业推广硕士、兽医硕士、风景园林硕士、公共卫生硕士（MPH）、军事硕士、工商管理硕士（MBA）、会计硕士（MPAcc）、公共管理硕士（MPA）。

从专业硕士发展的历史过程，我们可以看出专业硕士的招生具有非常明确的职业背景要求，主要面向在职人员。显然，这与面向应届生招生的学术性硕士不同。

首先，培养目的和方式的侧重点不同。专业硕士与学术性硕士的培养虽然处于同一层次，但两者之间的培养规格各有侧重，在培养目标上也有明显的差异。学术性硕士学位的设立是按学科分类，以学术研究为导向，偏重理论和研究，主要是为高等学校和科研机构培养专门的研究人员。专业硕士的培养方式主要以专业实践为导向，重视实践和应用，目的在于为企业等机构培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才。专业学位教育的突出特点是学术性与职业性紧密结合，获得专业学位的人，主要不是从事学术研究，而是从事具有明显的职业背景的工作，如工程师、医师、教师、律师、会计师等。虽然09年考研招生在部分专业硕士领域可以面向应届生招生，但是，在选择生源时，各高校还是要求具有一定的专业背景。中央民族大学研究生院的青觉院长在谈到培养方式方面时，就强调专业硕士与传统的学术性硕士相比，更强调实用，考生在报考全日制专业硕士的时候，最好有相关的工作经验和专业学科背景