[请关注胎儿的神经系统发育]专家表示，胎儿的神经系统发育是不好监测的，但准妈妈在怀孕期间，需做一些保健措施来促进胎儿的神经系统发育，同时，也要避免胎儿神经系统发育异常，那么准妈妈具体应该如何做?又应该...+阅读
近年来أ叶绿体基因间序列已被广泛应用于苔藓、球兰、骨碎补科、蓼科、常绿植物、角果木等植物系统发育性及地理亲缘关系。通过本实验来学习和研究如何运用软件基于trnT-trnL序列分析同科植物的遗传关系。 通过本实验能够熟练掌握数据采集和分析等分子实验中的常用方法أ进一步提高自己的收集数据的能力和数据分析工具的使用能力。 关键词ؤtrnT-trnL 物种 遗传关系统发育 系统发育أphylogenyؤ也称系统发展إ是与个体发育相对而言的إ它是指某一个类群的形成和发展过程。
大类群有大类群的发展史إ小类群有小类群的发展史إ从大的方面看إ如果研究整个植物界的发生与发展إ便称之为植物界的系统发育。同样إ也可以研究某个门、纲、目、科、属的系统发育إ甚至在一个包含较多种以下单位أ亚种إ变种ؤ的种中إ也存在种的系统发育问题。例如إ在单子叶植物的菝葜科أSmilacaceaeؤ中有各种类型的植物إ有木本的、草本的إ有直立的、攀缘的إ有单花序的、也有复合花序的等等。
这些类群之间在进化上有何联系ئ哪个类群较为原始ئ哪个类群较为进化ئ对这类问题的探讨就是探讨各类群的系统发育。种是分类的基本单位إ但在种之下又有亚种、变种、变型إ这说明在一个种的范围内إ也有变化和发展إ这就是种的系统发育。同样道理إ纲、目、科、属إ各个分类等级均有其系统发育。 系统发育树 系统学分类描述了不同生物之间的相关关系إ通过系统学分类分析可以帮助人们了解所有生物的进化历史过程。
这一过程并不能够直接看到إ人们只能通过相关线索了解历史上曾经发生了什么إ而科学家就是用这些线索建立各种假说、模型إ甚至是生命发生的历史。在系统学分类的研究中إ最常用的可视化表示进化关系的方法就是绘制系统发育进化树أPhylogenetic treesؤإ用一种类似树状分支的图形来概括各种أ类ؤ生物之间的亲缘关系。通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树称为分子系统树إmolecular phylogenetic treeئ。
进化树由结点إnodeئ和进化分支إbranchئ组成ا每一结点表示一个分类学单元إ属、种群、个体等ئا进化分支定义了分类单元إ祖先与后代ئ之间的关系ا一个分支只能连接连个相邻的结点。进化树分支的图像称为进化的拓扑结构ا其中分支长度表示该分枝进化过程中变化的程度ا标有分枝长度的进化分支叫标度枝إscaled branchئ。校正后的标度树إscaled treeئ常常用年代表示ا这样的树通常根据某一或部分基因的理论分析而得出。
进化分支可以没有分支长度的标注إunscaledئا没有被标注的分支其长度不表示变化的程度ا虽然分支的有些地方用数点进行了注释。 进化树可以是有根的（rooted）ا也可以是无根的إunrootedئا分为“有根树”和“无根树”两类 。在有根树中ا有一个叫根إrootئ的特殊结点ا用来表示共同的祖先ا由该点通过唯一途径可产生其他结点ب有根树是具有方向的树ا包含唯一的节点ا将其作为树中所有物种的最近共同祖先。
无根树只是指明了种属的相互关系ا没有确认共同祖先或进化途径。最常用的确定树根的方法是使用一个或多个无可争议的同源物种作为“外群”إ英文outgroupئا这个外群要足够近ا以提供足够的信息ا但又不能太近以致不能和树中的种类相混。把有根树去掉根即成为无根树。一棵无根树在没有其他信息إ外群ئ或假设إ如假设最大枝长为根ئ时不能确定其树根。
无根树是没有方向的ا其中线段的两个演化方向都有可能
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