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遗传因素：单纯性肥胖者多有家族史，观察肥胖者收养的子女与肥胖者生养的子女，发现后者出现肥胖的概率远远高于前者，有时在同一个家庭中同样会出现这种情况，这就无法用后天饮食结构与生活习惯来解释了。科学家通过深入的研究，发现了遗传在其中的影响，这些遗传因素的影响来自于基因作用的结果，目前已有十多个易感基因与肥胖病相关。
从家族遗传的角度来分析，父母肥胖的，子女出现肥胖的可能远较非肥胖父母子女者高。有统计显示肥胖者中60%～80%有肥胖病家族史，在对1 556例肥胖者的调查中发现，双亲肥胖，其子女肥胖率达60%～87%，而对照组仅36%;母亲肥胖101例中，其子女肥胖率为51%，而对照组为38%;父母均不肥胖，子女仅10%肥胖。
既然肥胖病具有遗传的背景，是不是说肥胖病的决定因素就是遗传了呢？回答显然是否定的。尽管遗传因素在肥胖的形成中具有一定的作用，但不是惟一的。造成肥胖的因素是多方面的，饮食、运动、胰岛素反应、社会心理因素等都可成为肥胖病发病的因素之一，况且肥胖病的遗传因素还是多基因作用的结果，而非单一的基因。在日常生活中我们也可发现父母不胖而子女较胖的现象，这种现象还不少，这应该不是遗传作用的结果了。另外，最新研究资料指出：成人脂肪细胞仍有较强的繁殖能力，成年肥胖者的脂肪细胞能以儿童期的速度继续繁殖，这更是反映了非遗传因素的作用。
神经精神因素：人类和很多动物的下丘脑中有两对与摄食行为有关的神经核：一对为腹内侧核；另一对为腹外侧核，又称饥中枢。饱中枢兴奋时使人产生饱感而拒食，饥中枢兴奋时使人产生饥饿感而进食。两者相互调节，相互制约，处于动态的平衡中，从而使人的食欲保持在正常范围内，维持人体相对稳定的体重。 可能有人有这样的经历，在生气的时候，往往不思饮食，而在焦虑的时候，往往会不停地吃一些零食，其实这是精神因素对食欲的影响。当精神过度紧张时，人的交感神经兴奋、肾上腺能神经受刺激，食欲就受抑制；而当迷走神经兴奋时，胰岛素分泌增多，食欲就会亢进。从这个意义上讲，凡能引起人的交感与迷走神经兴奋的因素，只要这种刺激达到了一定的程度，都会引起人体的肥胖或消瘦。有人推断，在体内有一种叫瘦素的物质，它是来自脂肪组织的信使，是一种蛋白体，由下丘脑分泌，进入外周血中，它的主要作用之一是通过抑制神经肽Y的合成和释放，后者可增加摄食，减少产热并使胰岛素水平升高。瘦素告知大脑人体存有多少脂肪，从而由大脑来调节脂肪的代谢，在肥胖病患者中，这一信号输送可能存在问题。
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