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基质是细胞质中均匀一致的物质，填充在有形结构之间的空隙内，其化学成分为大分子蛋白质、糖、无机盐等。这是细胞质基质，还有线粒体基质和叶绿体基质等基质。
原生质是构成细胞的生活物质。原生质是生命的物质基础。组成原生质的化学元素主要有C、H、O、N，这4种元素约占细胞全重的90%以上；其次，有S、P、K、Na、Ca、Mg、Cl、Fe等元素，约占细胞全重的百分之几；此外，还有B、Si、Mn、Co、Cu、Zn、Mo等微量元素。组成原生质的各种化学元素，互相结合成多种化合物，如水分、无机盐、糖类、脂类、蛋白质和核酸等，原生质则是以游离形式存在的自由水为分散介质，以蛋白质等各种大分子为分散相的复杂胶体系统。在原生质胶体系统中，各种大分子之间相互作用，聚合成膜状、线状和颗粒状等基本造形，各种基本造形结构单独或互相结合，形成原生质中的亚显微结构和显微结构。在细胞的生命活动中，原生质中各种微细结构各自有着特定功能，彼此间在功能上又协调一致，使细胞成为生命的单位。许多微细结构在细胞的生命活动中不断进行自我更新。综上所述看出，原生质是由水的胶体溶液和各种微细结构组成的、能够自我更新的动态体系，是细胞生命活动的物质基础。
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