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生物碱是存在于大自然动植物及蕈类中的胺类分子。很多的生物碱都对人或动物有药理反应。生物碱大都是氨基酸的衍生物，尝起来有苦涩味。它们常以次生代谢物的形式出现于植物（例如：马铃薯、蕃茄）、动物（例如：贝壳类）及蕈类。大部份的生物碱皆能由它们的植物提取液中以酸-碱萃取获得。生物碱的英文为“alkaloid”，这个字由“alkaline”一字衍生而成。

原本“alkaloid”泛指一切含有氮的碱基。 虽然大部份的生物碱对于人体有毒，但也有些能入药。主要有镇痛或麻醉的作用，以吗啡及可待因的作用尤其显著。[编辑]生物碱的分类吡啶类：胡椒碱、毒芹碱、胡芦巴碱、槟榔碱、四氢烟碱酸、毛果芸香碱、金雀花碱、烟碱、鹰爪豆碱、石榴碱吡咯烷类：古豆碱、红古豆碱、烟碱莨菪烷类：颠茄碱、可卡因、芽子碱、东莨菪碱喹啉类：金鸡纳碱、奎尼丁、二氢奎宁、番木鳖碱、马钱子碱、藜芦混碱、藜芦碱异喹啉类：吗啡、可待因、蒂巴因、罂粟碱、那可汀、血根碱、北美黄连碱、小檗碱苯乙胺类：仙人掌碱、麻黄素吲哚类： 色胺类：二甲基色胺、N,N-二甲基-5-甲氧基色胺（5-MeO-DMT）、蟾蜍皮腺素、裸盖菇碱、血清素麦角灵类：麦碱、麦角胺、麦角酸、麦角新碱β-咔啉类：肉叶芸香碱、育亨宾碱、蛇根碱（利血平）、吐根碱长春花类：长春碱、长春新碱马钱子类：番木鳖碱、马钱子碱（布鲁辛，即2,3-二甲氧基番木鳖碱） 伊波加因、伏康京碱、冠狗牙花啶碱嘌呤类： 黄嘌呤类： 咖啡因、可可碱、茶碱类萜类： 乌头类：乌头碱甾体类： 茄属：茄啶、茄碱（龙葵碱）、卡茄碱藜芦属：藜芦胺、环巴胺、3-葡萄糖基-11-去氧芥芬胺、介藜芦胺、muldamine真螈：Samandarin其他：康丝碱季铵盐类：毒蕈碱、胆碱、神经碱其他：辣椒素、洋蓟素、商陆碱、商陆毒...

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