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1、紫外吸收：

波长不同：蛋白在280 nm，核酸在260 nm.这取决于生色团，即分子结构.

均一性不同：核酸的每种碱基都有吸收，而且相差不多，因而定量时线性很好；蛋白的20种构件中只有三种有吸收，相互差异也较大，所以蛋白用紫外吸收定量比较困难.

2、带电机理：

核酸和核苷酸既有磷酸基，又有碱性基团，所以在溶液中为两性电解质，因磷酸的酸性强，通常表现为酸性。RNA在室温条件下被稀碱水解成核苷酸而DNA对碱较稳定，常利用该性质测定RNA的碱基组成或除去溶液中的RNA杂质。

氨基酸由于含有氨基和羧基，因此在化学性质上表现为是的一种兼有弱碱和弱酸的两性化合物。氨基酸在溶液中的带电状态，会随着溶液的pH值而变化，如果氨基酸的净电荷等于零，在外加电场中不发生向正极或负极移动的现象，在这种状态下溶液的pH值称为其等电点，常用pI表示。在等电点是，氨基酸的溶解度最小，容易沉淀析出。

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