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轮状病毒疫苗在我国的接种体系中属于自费疫苗。这个疫苗属于减毒活疫苗，也就是活病毒，所以口服轮状病毒疫苗后可以引起呕吐、腹泻等消化道症状，以及较低的发热等，但这些副作用可能并不常见。

目前全球范围只有3种获批准的轮状病毒疫苗上市，国外为单价的Rotarix，和5价的人牛重配RotaTeq，国内由生物制品研究机构研制的疫苗，采用的是羊源病毒经细胞培养而成。如果把这3个疫苗简单比较，R0tarix用的是人源的病毒株，RotaTeq是5价疫苗且为基因重配产品(5价疫苗可以预防5个血清群病毒的感染)，且这两种疫苗使用广泛，从理论上要优于国内疫苗。

国外的两个疫苗均要求在婴儿早期接种(口服)，首剂不晚于12周龄，接种完成最迟32周龄。Rotarix保护率据称可达96％，对住院标准的感染保护率为85％。RotaTeq总保护率为74％，对严重轮状病毒胃肠炎的保护率为98％。两种疫苗的保护力都宣称为一年以上。但轮状病毒腹泻在2岁左右的幼儿亦有发生，换言之，任何一种轮状病毒疫苗都不能对宝宝提供完全保护。

有人说轮状病毒疫苗容易引起肠套叠，事实是1998年确实有一个疫苗可能发生了肠套叠，最终这个疫苗退市。而世界卫生组织要求12周龄内接种，也是为了防止发生严重的肠套叠，这个接种建议应该严格遵守。

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