[时间序列的水平分析]对时间序列的统计处理,课本中涉及到的有水平分析和速度分析。水平分析包括发展水平&增长水平(即增长量),速度分析包括发展速度&增长速度。重点是掌握基本概念、典型题目的计算方法...+阅读
将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框。 参数说明如下: Results 分析结果显示 其中包括: Show summary(显示概要) Show sites on sequence(在结果中显示酶切位点) Draw restriction map(显示限制性酶切图)Draw restriction pattern(显示限制性酶切模式图) Ignore enzymes with more than(忽略大于某设定值的酶切位点) Ignore enzymes with less than(忽略小于某设定值的酶切位点) Target DNA (目标DNA 特性) circular(环型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化) 参数说明如下: Enzyme 代表(enzyme data file),点击旁边的下拉按钮,出现两个默认选项,restrict.enz 和dnamane.enz, 如果添加过自制的酶列表,则附加显示自制酶列表文件名。
其中restrict.enz 数据文件包含180 种 限制酶,dnamane.enz 数据文件包含2524 种限制酶。选择其中一个数据文件,相应的酶在左边的 显示框中列出(按酶名称字母表顺序),鼠标双击酶名称,则对应的酶被选中,在右边空白框中列 出。要自制酶切列表,可以从左边酶列表中双击鼠标选择多种酶(例如puc18 multiple cloning sites), 然后点击按钮出现下列对话框: 输入要保存酶列表的文件名,点击按钮即可保存。
自制酶列表可以方便分析特定的酶切位点。 Cutter 酶切识别序列长度;End 酶切产生的末端,其中包括,Blunt(平头末端),5'Overhang (5'突出粘性末端),3'Overhang(3'突出粘性末端),系统根据cutter 和end 的设定情况,在左边酶列表 中显示符合条件的酶。最后,点击按钮执行操作。
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