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植物保护学科主要是由植物病虫害专业发展而来的。学位制度恢复前一些农业院校的植物保护学科已包含植物病理学、农业昆虫学和植物化学保护三个专业。l983年制定的《高等学校和科研机构授予博士和硕士学位的学科、专业目录（试行草案）》中，这三个专业分属于农学一级学科内的植物病理学、昆虫学和农药及农用化学制剂三个二级学科。
昆虫学科还同时并存于生物学一级学科内。l990年修订的《授予博士、硕士学位和培养研究生的学科、专业目录中》，昆虫学科被合并为生物学一级学科内的一个二级学科，而农药学科和植物病理学科仍作为农学一级学科内的两个二级学科。根据“科学、规范和拓宽的原则以及本学科的发展状况和在农业上的重要性，1997年颁布的新专业目录将植物保护学科列为农学门类中的一个一级学科，其中含植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学三个二级学科，从而形成了以农作物病虫草鼠等有害生物发生发展规律和控制为主要研究内容的完整知识体系。
现代植物保护学科发展的总趋势是朝着微观、宏观两个方向发展，同时在宏观指导下进行微观研究，并将并将微观资料进行宏观分析和处理，不断发展病虫治理新理论和新技术在宏观方面，应用生态学和系统工程学的原理和方法建立农业生态系统中病虫害监控决策体系；在微观方面，以分子生物学和基因工程的理论和技术为基础对病虫灾变机理进行分析，并为决策提供依据。
21世纪植物保护学科的发展必将为建立有利于提高农业的综合生产能力，保护生物多样性，控制环境污染和节约能源的植物保护技术握供理论知识和技能。并通过对农业生态系统的有效调控，提高农作物生物灾害控制工作的系统性、综合性、科学性和可持续性，为农业的可持续发展和生态环境的保护提供保障。 植物保护学科作为农学门类中四个与种植业有关的一级学科之一，具有明显的跨学科特色。
它与农学门类中的作物学、园艺学和农业资源利用等一级学科有密切的联系。它与生物领域中的大多数二级学科，如动物学、植物学、植物生理学、微生物学、遗传学、生态学、细胞生物学、主物化学、分子生物学以及工学中的化学工程与技术等学科也有着密切的关系。植物保护学科属于生命科学范畴，它与其他学科具有相互依存、共同发展的关系。
它的发展既积极、合理利用生命科学的研究成果，同时又不断丰富和发展生命科学的内容。植物保护学科中植物病理和农业昆虫与害虫防治两个二级学科分别在群体、细胞和分子水平上研究病虫等有害生物与寄主植物的相互作用和病虫害发生发展的规律，探讨病、虫致害机理和寄主植物抗性机理，为有害生物的控制提供理论和技术基础。当前有害生物与寄主植物的相互作用研究已成为植物保护学科中的新兴领域，形成了以识别、信号传递和防卫基因表达三个环节为主的理论体系。
而农药学二级学科为有害生物的控制提供有力的武器，它以传统化工产品为基础，在新产品研制和农药的使用方面更加重视吸收有害生物与寄主植物相互作用的研究成果。进一步发展高效、低毒、低残留新产品，对有害生物治理和绿色农业的发展将发挥更大的作用。植物保护学科将以崭新的面貌迈向2l世纪，并以学科建设为重点，以国际先进水平为目标，对农作物重要有害生物的灾变规律、成灾机理、预测预警的理论和技术以及有害生物控制的理论和技术等进行系统、全面的研究.重视现代高新技术在基础研究中的应用以满足农作物有害生物持续控制关键技术开发对基础研究的要求。
同时不断改革教学内容与课程体系，提高研究生培养的质量，为我国农业再上新台阶，实现有害生物可持续控制和农业可持续发展以及培养高学历、高素质、高水平的专业人才做出新的贡献。 学科研究范围：昆虫生理学及生物化学，昆虫生态学，昆虫（螨）分类学，昆虫病理学和生物防治，昆虫行为及化学生态学，昆虫遗传学与分子生物学，昆虫药理学，城市与储藏昆虫学，资源昆虫学，农业昆虫（蛹）与有害生物综合治理，作物抗虫性原理及应用，植物检疫。
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