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在受精卵初期分裂时，若发生了某种错误，染色体的一部分消失，或是额外长出一部分，便会产生出其中有一对染色体含有三条。有少数情况是亲代之一本身就多含了一条染色体，而遗传给子女。此型为异位型(translocation)，目前可利用绒毛膜采样，或羊膜穿刺术检查唐氏综合症。

三染色体会造成下一代心理和生理上的缺陷。三染色体最常造成的疾病为唐氏综合症。每1000名儿童中即有一名此类患者。三染色体型的唐氏综合症发生情形是×性的，而异位型的唐氏综合症则是遗传的。因此，了解家族性唐氏综合症病史是相当重要的。

唐氏综合症儿的发生率，会随高龄母亲(超过35岁)的年纪增加，但亦可能受高龄父方影响。因此，亲代任何一方年龄超过35岁时，在怀孕前应看遗传门诊。

有时，染色体异位(translocation)也会造成遗传疾病。虽然整条染色体看似正常，但有些却是由不同染色体的片段连接而成的。带有这种排列不正常的染色体，亲代本身可能是健康的，如果下一代遗传了这个多出来的染色体，就可能罹患不幸的疾病。

异常的性染色体可能造成性别发育、不孕及心智障碍等缺陷。男孩子可能出现克莱费德氏症候群，而女孩则可能出现透纳(Turner)氏症候群。

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