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1，两者的学位一样，全日制专硕有毕业证、学位证双证，工程硕士只有学位证。 2，不过专业硕士学制2年（与全日制的3年学术型硕士相对应），入学参加每年年初的统招考研，以及学校自行组织的复试、面试。一般都是自费，很少有奖学金（目前很多专硕都是考研成绩不太理想被调剂过来的）。专业硕士的目的是面向生产和一线，直接参与企业的研发、创新、技术改革等技术层面。 3，工程硕士理论上是2.5-5年，弹性学制，同时也是在职学习，入学时参加每年10月底的全国GCT联考，同样也要参加学校的复试和面试。这种学习所有的人事关系都在原单位，也没有奖学金一说。面向范围，一般工程硕士都是本科毕业后3年，在职人员进行的理论深化和技术提高。
关于工程硕士和专业硕士
工程硕士 就 是专业硕士
而普通的硕士 是 学术型硕士
具体的请看下面
专业硕士对大家来说或许很陌生，但说到MBA、MPA却是耳熟能详。其实，MBA、MPA正是专业学位中的两种类别。目前，我国经批准设置的专业硕士已达15类。
专业硕士学位主要包括：工商管理硕士专业学位（MBA）、公共管理硕士专业学位（MPA）、工程硕士（ME）、法律硕士（J.M）、会计硕士专业学位（MPACC）、公共卫生硕士专业学位（MPH）、农业推广硕士专业学位、兽医硕士专业学位、教育硕士专业学位等。今年年初，又新增了艺术硕士、体育硕士、风景园林硕士3个专业学位。
专业硕士是我国研究生教育的一种形式。根据国务院学位委员会的定位，专业学位为具有职业背景的学位，培养特定职业高层次专门人才。
专业硕士教育的学习方式比较灵活，大致可分为在职攻读和全日制学习两类。比较简单的区分办法是：招收在职人员、以业余时间学习为主的专业学位考试通常在每年的10月份进行，名为“在职人员攻读硕士学位全国联考”，简称“联考”；招收全日制学生的专业学位考试与每年年初举行的“全国硕士研究生统一入学考试”（简称“统考”）一起举行。
【专业硕士与普通硕士有什么不同】
培养方向不同
根据我国的有关规定，普通硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位；而专业硕士是具有职业背景的硕士学位，为培养特定职业高层次专门人才而设置。
招生条件不同
专业硕士要求报考者有一定年限的工作经历，而普通硕士则不需要。绝大多数专业硕士还要求在职人员报考需经所在单位或相应管理部门的同意，有的甚至要求所在单位推荐等。
招生考试不同
对学生来说，普通硕士的招生考试只有年初的“统考”，而统考以外的专业考试则由各招生单位自行命题、阅卷。专业硕士的招生考试有10月份的“联考”和年初的“统考”两次机会，考生可以自行选择，而这两大国家级别的考试的专业考试，也由各招生单位自行命题、阅卷。
文凭颁发不同
与普通硕士不同，大多数专业硕士只授予学位证书，没有学历证书。但也有例外，例如工商管理硕士、法律硕士、临床医学硕士、建筑学硕士等，就同时颁发学位和学历证书。大体来看，“统考”生拿“双证”，“联考”生拿“单证”。
强势项目
这些专业硕士学位教育项目推出时间较早，已形成很高的知名度，并具有一定的市场，是专业硕士教育领域的“大牛股”。特别是MBA、EMBA等，由于具有“管理精英摇篮”的美誉，而人气旺盛。
专业硕士和工程硕士的差别是什么
工程硕士绝对不是全日制专业硕士。本人现在读的就是全日制专业硕士。在录取分数线上，全日制专业硕士和普通的硕士分数是一样的。没有高低之分。
专业硕士教育的学习方式比较灵活，大致可分为在职攻读和全日制学习两类。比较简单的区分办法是：招收在职人员、以业余时间学习为主的专业学位考试通常在每年的10月份进行，名为“在职人员攻读硕士学位全国联考”，简称 “联考“ ，修业后学历依然是 “本科” 。但是，有专业硕士学位招收全日制学生的专业学位硕士在每年年初举行的“全国硕士研究生统一入学考试”（简称“统考”）中举行，毕业后学历是 “研究生” ，两者不能混为一谈，全日制专业硕士是学历教育，而以往的GCT在职硕士不是学历教育。
而工程硕士是工作以后再读的硕士，不参加一月份的统一考试的。主要是为工矿企业和工程建设部门，特别是国有大中型企业培养应用型、复合型高层次工程技术和工程管理人才。工程硕士分为全日制工程硕士和GCT工程硕士。
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