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从NCBI上可以直接下载各种格式的序列文件，clustal是可以读取fasta格式的。具体看看图吧。

图示搜索核酸序列之后，选择自己想要的序列然后下载到本地磁盘。

序列下载下来就可以用clustal打开了。

另外，最好不要把fasta序列文件放到桌面，貌似有些版本的clustal不能装入放在桌面的序列文件。

以下为关联文档：

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