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primer primer5怎么设计引物

02月10日 编辑 39baobao.com

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首先打开软件

左上角来操作

file——new——dna sequence

这一项可以把你复制的序列粘贴进去

当然,你也可以选择另一个

file——open——dna sequence

去open一个新的文件。在接下来的界面里

复制你的序列,于是就将序列导入了点击search

进入下图界面开始设计引物

在此图中有6个部分,红色数字标示

1区,包括三部分,可以选择设计pcr引物,测序引物和杂交探针

2区,搜寻模式,包括正链,反链等,我们一般选最后一项pairs,出来一组引物

3区,引物的范围,上游引物所在范围,下游引物所在范围

4区,pcr 长度,根据需要设置

5区,引物长度,这个是调整的重点,前面是长度,后面是±

6区,选择模式,一般选auto,也可以手动下面是一个设计

我选择了

正链位于1-400内

负链位于500-910内

产物长度100-600

引物长度为20±1bp

输入后,出现下图界面

共有1000多条引物

点击ok

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