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请教关于TCGA数据的问题

01月07日 编辑 39baobao.com

[Oracle数据库的性能怎样优化]一、通过操作系统的一些工具检查系统的状态,比如CPU、内存、交换、磁盘的利用率,根据经验或与系统正常时的状态相比对,有时系统表面上看起来看空闲这也可能不是一个正常的状态,...+阅读

Case列显示的是该文件里数据来自于多少cases。比如569,说明这个文件整合了所有569个cases的genotyping数据,有些数字为1的,说明这个文件里只有一个case的数据。对于RNAseq后续的分析,如果要用软件比如limma,edgeR比较表达差异的基因,就用counts数据。如果你想自己做t-test,下载counts数据自己做normalization再进行比较也行,或者下载已经做过normalization的RPKM/RPKM-UQ直接比较也行癌旁的数据也包含在这些cases里了,下载metadata就能看到每个sample的信息,你会发现有些是来自solid tissue normal,这些都是癌旁的数据...

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