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不同的地区、不同类型的兔场，其免疫程序不尽相同。一般来说，免疫程序要根据当地兔病的流行情况来制定，其中危害性比较大的几种传染病疫苗免疫一定要做好[如兔病毒性出血症（兔瘟）、巴氏杆菌病、魏氏梭菌病]，每种疫苗需做初免和二免。具体来说，在环境污染严重地区，仔兔断奶后先注射兔病毒性出血症灭活疫苗，间隔7天后注射兔多杀性巴氏杆菌病灭活疫苗，再间隔7天后注射兔产气荚膜梭菌病（A型）灭活疫苗。

每种疫苗免疫1个月后要再用上述单苗免疫1次。以后每隔5-6个月用单苗或联苗加强免疫1次。在安全地区或饲养规模比较小的兔场，则在仔兔断奶后用兔病毒性出血症、多杀性巴氏杆菌病二联灭活疫苗免疫1毫升，间隔20-30天后再用上述二联灭活疫苗加强免疫1毫升，以后每隔半年用上述二联灭活疫苗再加强免疫2毫升。 种兔每年免疫两次。必要时还要免疫兔产气荚膜梭菌病（A型）灭活疫苗1-2次。

此外，兔场若存在其他比较严重的传染病（如兔大肠杆菌病、葡萄球菌病、支气管败血波氏杆菌病等）时，还要相应地增加这些传染病的疫苗免疫。当兔场发生某种传染病时，在确诊的前提下，为了迅速控制和扑灭该传染病，最大限度地减少损失，可对疫群、疫区和受威胁的兔群进行紧急免疫接种。 其中接种顺序原则上先从受威胁兔群开始免疫，最后接种已经发病的疫群。

实践证明，在疫区内对患有兔病毒性出血症（兔瘟）、魏氏梭菌病、巴氏杆菌病、支气管败血波氏杆菌病等疾病的兔群进行疫苗紧急接种，对控制和扑灭这些疾病有重要作用。需注意的事项是，在采取紧急免疫后很有可能会在短期内（7-8天）增加死亡数量，一般10天后，发病和死亡数量会明显下降，最终控制病情。 如果10天后死亡率仍居高不下，那么还要请兽医看看是否存在其他疾病的并发感染或存在误诊情况。

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