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不孕的原因可能在女方、男方或男女双方。属女方因素约60%，男方因素约30%，属双方因素约10%。
(1)外阴阴道因素：
①外阴、阴道发育异常：两性畸形包括真两性畸形和假两性畸形，后者如睾丸女性化、先天性肾上腺皮质增生、卵巢男性化等。
处女膜发育异常：处女膜闭锁、坚硬处女膜等。
阴道发育异常：先天性阴道完全或部分闭锁，双阴道或阴道中隔。
②瘢痕狭窄：阴道损伤后形成粘连瘢痕性狭窄，影响精子进入宫颈，影响授精。
③阴道炎症：主要有滴虫性阴道炎和真菌性阴道炎，轻者不影响受孕，严重时大量白细胞消耗精液中存在的能量物质，降低精子活性，缩短生存时间，甚至吞噬精子而影响授精。
(2)宫颈因素：宫颈是精子进入宫腔的途径，宫颈黏液量和性质都会影响精子能否进入宫腔。
①宫颈发育异常：先天性宫颈狭窄或闭锁，轻者经血排除不畅、经量减少、痛经，可能并发子宫内膜异位症。宫颈管发育不良，细长，影响精子通过；宫颈管黏膜发育不良则腺体分泌不足。
②宫颈炎症：严重时宫颈管内脓性白带增多、黏稠，影响精子穿透。
③宫颈赘生物：宫颈息肉、宫颈肌瘤等阻塞宫颈管影响授精。
(3)子宫因素：
①子宫先天性畸形：子宫发育异常 如先天性子宫缺如、残角子宫、双角子宫、纵隔子宫等均影响受孕。
②内膜异常：子宫内膜炎、内膜结核、内膜息肉、内膜粘连或子宫内膜分泌反应不良等影响受精卵着床。
③子宫肿瘤：内膜癌引起不孕，子宫内膜不典型增生患者大部分不孕，子宫肌瘤可影响受孕，黏膜下肌瘤可以造成不孕或孕后流产。
(4)输卵管因素：输卵管具有运送精子、拾卵及将受精卵运送至宫腔的功能。输卵管病变是不孕症最常见因素，任何影响输卵管功能的因素都影响授精。
①输卵管发育不全：输卵管发育不良影响蠕动，不利于运送精子、卵子和受精卵，易于发生输卵管妊娠；先天性输卵管过度细长扭曲影响精子或卵子的运行。
②输卵管炎症：输卵管炎可造成伞端粘连或管腔阻塞，输卵管与周围组织粘连影响蠕动而不孕。输卵管结核造成输卵管僵直、瘘道等。
③输卵管周围病变：以子宫内膜异位症为多，异位内膜在输卵管内形成结节或盆腔外异位内膜造成输卵管粘连。
(5)卵巢因素：
①卵巢发育异常：多囊卵巢、卵巢未发育及卵巢发育不全。
②子宫内膜异位症：传统的观点认为子宫内膜异位症即为子宫内膜超过宫腔范围（不包括子宫肌层）的外在生长。当具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的身体其他部位时，称为子宫内膜异位症（endometriosis）。子宫内膜异位症与不孕关系，据天津与上海两地报告，子宫内膜异位症患者原发不孕占41.5%~43.3%，继发不孕为46.6%~47.3%，而正常人群不孕率为15%。重度子宫内膜异位症造成粘连，影响卵巢功能，妨碍卵细胞的成熟与释放。
③黄素化未破裂卵泡综合征（luteinized unruptured follicle syndrome,LUFS）:Brosen推测LUFS是子宫内膜异位症致病因素之一，依据是LUFS者由于卵泡未破裂，腹水中17-β雌二醇和孕酮较正常为少，失去对异位子宫内膜细胞的抑制力，患者卵巢无排卵。
④黄体功能不足：异位症患者黄体期分泌不足影响受孕。
⑤卵巢肿瘤。
(6)排卵障碍：引起卵巢功能紊乱而致不排卵的因素都可致不孕。
①中枢性影响：下丘脑-垂体-卵巢功能轴紊乱，引起月经失调，如无排卵性月经、闭经等；垂体肿瘤引起卵巢功能失调而致不孕；精神因素如过度紧张、焦虑对下丘脑-垂体-卵巢轴可产生影响，抑制排卵。
②全身性疾病：重度营养不良、过度肥胖或饮食中缺乏某些维生素特别是E、A和B，可影响卵巢功能；内分泌代谢方面的疾病如甲状腺功能亢进或低下，肾上腺皮质功能亢进或低下，重症糖尿病等也能影响卵巢功能导致不孕。
③卵巢局部因素：先天性卵巢发育不全，
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