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Pycharm相比Spyder的优点是：

1 调试更方便，Spyder在其他文件里面设置断点，竟然无法停下来，必须得在主程序里面设置一个断点，然后“Step into”，如果嵌套比较深的话，这种方法特别麻烦。 Pycharm就没有这个问题。

2 Pycharm的“Reformat code”功能我特别喜欢，可以自动将你的代码排版规范，比如=两边各空一格，函数结尾空两行等等，不止能作用于一个文件，而且能一次性作用于整个项目！

Pycharm的缺点：

1 最新版本虽然支持了ipython，但功能体验比较差，1，反应比较慢 2 tab键经常不能弹出对象的属性与方法。

2 没有workspace。

所以，我的建议是结合使用这两个工具，基本上能达到MATLAB的使用体验。

2016年3月14日的补充

经过一段时间使用，也发现了Anaconda的缺点。特别是spyder。

1 在workspace里，对数据量偏大一点的变量进行查看，容易卡死，而MATLAB不会。

2 再workspace里，浮点数只显示小数点后三位，我经常要手工修改为显示为小数点后6位，不知道怎么修改默认设置。

3 断点调试明显没有MATLAB方便。

4 没有MATLAB那样方便的Profiler，用于发现代码运算瓶颈，而Spyder没有。

还有其他的，就不一一列举了，总之，在IDE上，Spyder相比MATLAB差远了，但我用Python，仍然会用Spyder，因为目前没有更好的替代品。

原答案：

千言万语汇成一句话： 安装Anaconda!

Anaconda非常适合做研究.Pycharm适合做开发，而不是研究.

为什么说Anaconda好呢？

1 自带了很多适合搞科学研究的库，比如numpy, scipy, pandas, matplotlib, sympy, sklearn等.

2 里面的spyder的界面非常像matlab的界面， 还支持单步调试.编辑器像matlab那样，可以创建cell（使用#%%，与matlab类似），方便查看与调试。

3 里面的ipython notebook， 非常适合交互和展示成果.

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