吴奇隆的感情生活也一直不顺，出道以来先后谈过几个女友（包括忧忧、徐若瑄）都是圈中人，其中，和同样背着一身债的蔡少芬的一段恋情最受瞩目。对于吴蔡二人的分手，有网友爆料是马雅舒的插足，而大家公认的是，在拍《萧十一郎》还完巨额负债的同时邂逅马雅舒，是吴奇隆人生一个更大悲剧的开始。当年，吴马二人的交往乃至2006年的婚姻都饱受争议，除小三一角极不讨喜外，媒体普遍认为当时马雅舒和吴奇隆在一起是看中了他的名气而不是真心喜欢。2009年，这一点似乎被验证了，马雅舒与外国新欢高调恋爱，据说还公然在拍摄现场同居，随之，吴马二人离婚的消息也被证实。尽管那段时间有关马雅舒劈腿的事被媒体和网友深挖，但大好人吴奇隆依然大度地把自己的房产、汽车、财产分给了对方，最终落得人财两空。