条带分开的程度看你实验的需求。如果你的Marker相邻两个条带相差100bp，而你的样本阳性结果和多带一个内含子的假阳性结果只差50bp（比方说你在做反转录PCR实验）那你当然需要分清楚一些。否则的话只要看得清楚你的样本条带是位于那两个Marker条带之间就可以了。 想要分开些跟胶厚度，点样都没有关系。提高琼脂糖浓度确实有影响，但不是一个线性的关系，琼脂糖浓度决定哪个大小范围的分得最开，不是所有条带都相同程度的分开，唉，看摆渡百科吧 “ 2、 琼脂糖浓度 一个给定大小的线状DNA分子，其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同。

DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小。分离小于0.5kb的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%，分离大于10kb 的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%。” 选定琼脂糖浓度的情况下，跑得时间越久分得越开。 在电泳开始时使用低压有利于条带清晰，是因为点样之后样品内分子是胡乱排列的，加上电压之后才统一方向排列好。

所以一小段时间的低压让它们都排列好，再转高压能够同时起跑。不然的话好比起跑线上有些人背对着终点站有些人面对有人侧对，结果一声枪响，本来同样速度的人跑出不同的结果来--同样大小的分子跑出来不在严格一条线，条带当然不完美咯。 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 哇，不好意思跟蛋白质电泳搞混了。其实一般不用放低压啦，尤其你才跑30分钟。

不过你的电压比我高很多。我一般是100V跑45分钟，但是电压跟胶的大小有关啦。只要跑出来结果没问题，就不要随意改动实验条件了。